Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC01553A4QN01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC01553A4QN01 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01553A4QN01 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01553A4QN01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms