Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CAMTA1Q9Y6Y1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMTA1Q9Y6Y1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms