Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX5Q9Y5X3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX5Q9Y5X3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms