Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3AQ9Y2H6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC3AQ9Y2H6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms