Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCE1Q9Y256 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCE1Q9Y256 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RCE1Q9Y256 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms