Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCML1Q9UN30 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCML1Q9UN30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCML1Q9UN30 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms