Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF19Q9UMS4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF19Q9UMS4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF19Q9UMS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms