Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD2Q9UKL4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJD2Q9UKL4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms