Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
REREQ9P2R6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
REREQ9P2R6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
REREQ9P2R6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms