Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COMMD8Q9NX08 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD8Q9NX08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COMMD8Q9NX08 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD8Q9NX08 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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