Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARMC1Q9NVT9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARMC1Q9NVT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARMC1Q9NVT9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC1Q9NVT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms