Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS2Q9NRF8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTPS2Q9NRF8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS2Q9NRF8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS2Q9NRF8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.4 ms