Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIPAS39Q9H9C1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPAS39Q9H9C1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VIPAS39Q9H9C1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPAS39Q9H9C1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms