Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF3Q9H4W6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF3Q9H4W6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF3Q9H4W6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms