Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAIP1Q9H074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAIP1Q9H074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAIP1Q9H074 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAIP1Q9H074 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAIP1Q9H074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms