Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA4Q9GZZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFRA4Q9GZZ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms