Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REXO4Q9GZR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
REXO4Q9GZR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms