Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CELF4Q9BZC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CELF4Q9BZC1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CELF4Q9BZC1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CELF4Q9BZC1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms