Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA16Q9BXB7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA16Q9BXB7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA16Q9BXB7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA16Q9BXB7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA16Q9BXB7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA16Q9BXB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA16Q9BXB7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms