Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPCDQ9BVM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DPCDQ9BVM2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPCDQ9BVM2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DPCDQ9BVM2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms