Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RSG1Q9BU20 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RSG1Q9BU20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms