Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF4Q9BSR8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF4Q9BSR8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF4Q9BSR8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms