Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX1AQ9BQ83 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX1AQ9BQ83 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX1AQ9BQ83 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms