Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP1Q96S65 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSRNP1Q96S65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP1Q96S65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms