Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF12Q96QT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF12Q96QT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms