Protein–RNA interactions for Protein: Q96N64

PWWP2A, PWWP domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWWP2AQ96N64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PWWP2AQ96N64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PWWP2AQ96N64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PWWP2AQ96N64 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PWWP2AQ96N64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms