Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP4Q96MN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP4Q96MN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP4Q96MN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP4Q96MN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms