Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLMNQ96JQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CLMNQ96JQ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLMNQ96JQ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms