Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB8

MPP4, MAGUK p55 subfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP4Q96JB8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP4Q96JB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MPP4Q96JB8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP4Q96JB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP4Q96JB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP4Q96JB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP4Q96JB8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP4Q96JB8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms