Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BCANQ96GW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BCANQ96GW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCANQ96GW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
BCANQ96GW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
BCANQ96GW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms