Protein–RNA interactions for Protein: Q96DW6

SLC25A38, Solute carrier family 25 member 38, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A38Q96DW6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A38Q96DW6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A38Q96DW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A38Q96DW6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A38Q96DW6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms