Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKD1Q969G9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKD1Q969G9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms