Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFKQ969G6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFKQ969G6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFKQ969G6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms