Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SELENOMQ8WWX9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SELENOMQ8WWX9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOMQ8WWX9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENOMQ8WWX9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms