Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2Q8WWK9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2Q8WWK9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP2Q8WWK9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.3 ms