Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPRQ8TBG9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNPRQ8TBG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNPRQ8TBG9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms