Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEIL3Q8TAT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL3Q8TAT5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms