Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR48Q8TAF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR48Q8TAF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms