Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLQ8NG68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLQ8NG68 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms