Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACVR1CQ8NER5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1CQ8NER5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1CQ8NER5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms