Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRFBP1Q8NEF9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.7 ms