Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87AQ8NBN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87AQ8NBN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM87AQ8NBN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM87AQ8NBN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM87AQ8NBN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM87AQ8NBN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM87AQ8NBN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms