Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NINQ8N4C6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINQ8N4C6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NINQ8N4C6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NINQ8N4C6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms