Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALNT4Q8N4A0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT4Q8N4A0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT4Q8N4A0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT4Q8N4A0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT4Q8N4A0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT4Q8N4A0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms