Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM42Q8IWZ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM42Q8IWZ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM42Q8IWZ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms