Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAB11FIP4Q86YS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms