Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP1Q7Z6B7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP1Q7Z6B7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP1Q7Z6B7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms