Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR53Q7Z5U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR53Q7Z5U6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR53Q7Z5U6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms