Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT28Q7Z3Y7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KRT28Q7Z3Y7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
KRT28Q7Z3Y7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KRT28Q7Z3Y7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms