Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYS1Q717R9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYS1Q717R9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYS1Q717R9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms